Историки указывают, что с самого начала Советский Союз не планировал присоединять Латвию, Литву и Эстонию.
В частности, еще 25 мая 1940 года руководство СССР рассматривало вопрос об обмене населением между Белорусской ССР и Литвой – репатриации литовского населения из Литвы в Белоруссию и, соответственно, наоборот.
Изменение позиции было связано с успехом Германии на западе Франции – поражением Франции и изменением военно-политической обстановки в Европе. Второй момент – планы руководства Литвы сотрудничать с Германией.
"В Берлине руководство Литвы обсуждало вопрос о возможности установления германского протектората над Литвой, что, в общем-то, нарушало, с точки зрения Кремля, сложившийся статус-кво. В этой ситуации, когда они видели, что Германия получила доминирующие позиции в Европе и что ведутся со стороны, по крайней мере, одной из прибалтийских стран попытки изменить сложившийся статус-кво, в Москве решили "забетонировать" ситуацию и просто ввести дополнительные войска в прибалтийские страны, вынудив их к этому ультиматуму", – рассказывал руководитель фонда "Историческая память" Александр Дюков.
Таким образом, если бы не действия литовского президента Антанаса Сметоны, страны Балтии могли пройти 1940 год без формального присоединения к СССР:
"С сохранением независимости и потом выходом из Второй мировой войны на тех же правах, как и другие страны Восточной Европы – входящие в состав организации Варшавского договора, но остающиеся суверенными и независимыми", – объяснял Дюков.
Краткая хроника присоединения
3 июня поверенный в делах СССР в Литве сообщает, что руководство республики стремится "предаться в руки Германии". В записке отмечается, что местные власти собираются сотрудничать с Германией, нарушив ранее заключенный с СССР договор.
Спустя 11 дней правительство СССР передало литовской стороне ультиматум, в котором потребовало немедленно сформировать новое правительство, "которое было бы способно и готово обеспечить честное проведение в жизнь советско-литовского Договора о взаимопомощи". 15 июня правительство Литвы согласилось на советские требования.
В тот же день в Литву был введен дополнительный контингент советских войск, 21 июля 1940 года была провозглашена Литовская Советская Социалистическая Республика, 3 августа 1940 года Литва стала частью Советского Союза.
Несмотря на то, что после введения войск в Литву президент республики Антанас Сметона настаивал на организации сопротивления СССР, большая часть правительства республики отказалась пойти на такой шаг. Не найдя поддержки, Сметона бежал в Германию. Литовский премьер Антанас Меркис, наоборот, согласился на сотрудничество с новой властью.